SNP位点验证服务/LDR_SNP检测

LDR_SNP检测

技术简介

LDR_SNP分型是一种将 PCR LDRLigase Detection Reaction,连接酶检测反应)相结合的检测技术。

检测原理

送样建议

浓度 (Qubit)

体积

总量

DNA 片段

≥40 ng/μL

≥20 μL

≥0.4 μg

DNA 无降解

注:SNP位点数>50个,每增加50个位点,体积增加10uL

 

技术参数

LDR_SNP检测

SNP位点<10

测序策略

反应重数

周期

检出率

3730xl

10X

55个自然日

95%

 

技术优势

1)周期短:小试之后,检测周期15个自然日;总检测周期55个自然日。

2)实验灵活:适合10个以内位点的检测,多重PCR重数可达到10重;

3)成本低:样本量越大,折合到单个数据点的成本越低。

4)精准度高:荧光探针标记,传统的3730xl平台;检出率可达95%以上。

案例分析

基于PCR_LDR检测CYP2C19多态性[1]

研究目的

细胞色素P450 2C19CYP2C19)基因型与药物代谢差异有关。本研究的目的是基于聚合酶链反应/连接酶检测反应(PCR-LDR)建立CYP2C19基因分型的可靠测定。

 材料方法

设计特异性引物和探针以检测CYP2C19 * 1* 2* 3* 17。制备每个等位基因的对照并用于性能评估,研究采用PCR-LDRSanger测序方法对200个临床样品进行检测分析。

研究结果

PCR-LDR检测的检出限为2 ng /μL基因组DNA。血液中常见的干扰物质不会影响检测结果。对于临床样品,PCR-LDRSanger测序的结果是相同的。该PCR-LDR检测方法可用于临床环境中CYP2C19基因型的检测。在氯吡格雷和质子泵抑制剂治疗之前,它将是筛查患者CYP2C19功能丧失等位基因的有用工具。

1 PCR-LDRCYP2C19基因分型的典型结果

参考文献

Zhang J, Zhang H, Li K, et al. Development of a Polymerase Chain Reaction/Ligase Detection Reaction Assay for Detection of CYP2C19 Polymorphisms[J]. Genet Test Mol Biomarkers. 2018, 22(1):62-73.

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